南水北调中线工程的主要渠道不仅是清水渠道，还是绿色渠道，与传统河道管理不同，以前多采用钢筋混凝土建造水库，不顾河道周边的生态环境，给生态环境造成了巨大破坏。目前南水北调中线工程将生态放在首位，大力开展生态林建设，开展有计划的流域综合治理，以生态农业为基础，改善现代生态农业的清淤生产方式、区域生态环境。对于河道淤积的原因，应采取以下措施:

(一)流沙处理措施:河道布局应尽量避免流沙段，必须切实采取施工措施，有条件或流沙段过短可以施工，经济条件达不到则采取大边坡。同时施工结束时要迅速积存一定水位的水，减少地下水的渗入。清泥工程在尽量不破坏河坡草皮植被的同时，还应用水下机械清泥保持一定的水头固坡。

(二)减少引黄蓄水堆积的措施:首先加强灌区工程和放水管理，沙含量过高引黄河水。逐步辅助和发挥灌区干旱、支、斗、农四级渠道工程，发展自流灌溉。严格控制混乱刮治现象，逐渐消除混水入沟后灌溉。河道引黄河水时，在沉沙池中沉沙后，利用水闸和排水工程引入河道。

(1)集成清淤方法:作为清淤的一环，应积极采用环保清淤方式，环保，成本综合考虑，结合多种清淤方式。水流使泥土中的污染物扩散，应尽量避免或在河泥污染较轻时采用。机械泥浆中的挖泥船不仅没有清除泥浆中污染负荷大的泥浆，反而搅动泥浆中堆积的污染物扩散污染，实际上应该在泥浆污染负荷低的河道采用。人工冲淤也要充分考虑河道结构现状和排泥条件。大力推进生态清淤，底泥污染负荷大时，首先要进行生态清淤，降低污染负荷，保持安全范围，然后再进行水力清淤或机械清淤。

(2)直吸式清淤:这是一种适合新型城市河流的机械清淤方法，该设备主要利用延伸到泥层的吸引口，使设备产生负压，从河底吸引泥浆。吸入口前要加入过滤器收集泥层垃圾，使机械传动与河道分离。这样的设备不仅能除去大部分淤泥，还能除去淤泥中污染严重的淤泥，并结合使用淤泥脱水设备。这个装置可以做成水上吸引船和水中清扫机器人的形状，不局限于河的宽度，水位，横穿河的构造物等要素。